יחידת הדפוס שלמכונת דפוס פלקסו מוערמתמוערם למעלה ולמטה, מסודר על אחד או שני הצדדים של לוח הקיר הראשי של החלקים המודפסים, כל קבוצת צבעי הדפסה מונעת על ידי גלגלי שיניים שמורכבים על לוח הקיר הראשי.בעת ההדפסה, המצע עובר דרך כל יחידת צבע הדפסה בתורו, השלם את כל ההדפסה.לכל קבוצת צבעי הדפסה יש גליל הדפסה, גליל לוח ומכשיר דיו, והמבנה של כל קבוצת צבעי הדפסה זהה.מכונת ההדפסה הפלקסוגרפית המוערמת יכולה להדפיס 1-8 צבעים, אבל בעיקר 6 צבעים.אם מצויד בהתקן היפוך, הוא יכול גם להדפיס משני הצדדים.